بحضور الاستاذ الدكتور (مشتاق عبد العظيم وتوت) عميد كلية الطب جامعة بابل ومدير الدراسات العليا الدكتور (هيثم علي الصائغ) وعدد من الاساتذة وطلبة الدراسات العليا جرت صباح يوم الثلاثاء 14/8/2018 مناقشة في علم الاحياء المجهرية لطالبة الدكتوراه (ساره عادل عبيد السعدي) عن اطروحتها الموسومة (دراسة التغاير الجيني بين العزلات السريرية لبكتريا الاشريشيا القولونية) حيث تألفت لجنة المناقشة من الاستاذ الدكتور (محمد عبد الاخوة الفحام) رئيسا وعضوية كل من الاستاذ الدكتورة (ازهار عمران الذهب) والدكتورة (ميساء صالح مهدي) والدكتورة (ايمان جواد كاظم) والدكتورة (زينب حمود السعدي) والاستاذ الدكتور (محمد صبري عبد الرزاق)عضوا ومشرفا" , تضمنت الدراسة جمع ومعالجه 100 عينة من مرضى يعانون من التهابات المسالك البولية ، التهاب المهبل ، الإسهال والجروح من مختلف الأعمار والأجناس، أحيلوا إلى ثلاث مستشفيات رئيسية في مدينة الحلة: مستشفى الحلة التعليمي العام ، مستشفى بابل مستشفى الولادة والاطفال ومستشفى مرجان التعليمي خلال فترة تتراوح من (فبراير إلى يونيو 2017).
وجد أنه 30 عزلة قد تم تحري عنها بواسطة التقنيات التقليدية من خلال استخدام الزرع و الاختبارات الكيموحيويه ، حيث تم الحصول على 10 عزلات (33?) من عينات الادرار ، 10 عزلات (33?) من عينات البراز , 7 عزلات (24?). من المهبل و 3 عزلات (10?) من الجروح.
بالإضافة إلى ذلك ، خضعت عزلات الاشريشيا القولونية E. coli للتشخيص التأكيدي باستخدام نظام Vitek2 المدمج وأظهر مؤشر التقرير التحليلي لهذا النظام أن معدل الاحتمالية للتشخيص سجل أكثر من 95? كفحص ممتاز، وتم الكشف عن أنه من بين (30) عينة من العزلات ألسريريه لل E. coli ، تم تأكيد 27 (90?) فقط بأنها E. coli وتم إهمال الثلاث (3) عزلات على أنها غير معطيه نتيجة بسبب الاحتمالية الواطئة والفحص الرديء.
اشتملت الدراسة على الكشف عن التنوع الجيني بين العزلات البكتيرية من خلال استخدام (ERIC-PCR) ، (REP-PCR) و (BOX-PCR) وتم تأكيد وجودها في الإشريشيا القولونية.
على الرغم من ذلك ، تم اختبار جميع العينات السريرية ال27 من بكتريا القولون لل homologous recombination مع box-element Pseudomonas aeruginosa ذو بادئ متخصص . وقد تمت الإشارة إلى أن recombination قد حصل بين السلالتين المختلفتين ( E.coli و Pseudomonas aeruginosa) التي لها موقع مخصص لنفس الهدف, كما أظهرت أن معدل المسافة عبرindex H كان حوالي 3.10 لelement - BOX مابين عزلات recombinants مع Pseudomonas aeruginosa.
ومع ذلك ، تضمن البحث تحليلاً لفئة جديدة من متواليات الحمض النووي المتكررة التي تمثل إستراتيجية دفاعية تم اكتشافها مؤخرًا ، والتي تعمل بمثابة نظام مناعي وراثي في المعركة بين الكائنات الدقيقة والعاثيات ، أو أي حمض نووي غريب.
تم إجراء دراسة الكشف الجزيئي لموقع CRISPR 2.1 باستخدام بادئ محدد وقد وثقت النتائج المفسرة بأنه قد اظهرت جميع عزلات المهبل والجروح نتيجة لـ CRISPR 2.1 بنسبة 100? بينما تظهر العزلات من الادرار والبراز أنماط تضخيم مختلفة حيث وجد أن عينات الادرار تعطي نتائج ايجابية لـ CRISPR 2.1 لثمانية عزلات فقط 8:10 (80?) والعزلتين الاخرتين اعطت نتيجة سلبية ، كما أظهرت النتائج المحققة من عينات البراز أن خمسة عزلات فقط 5: 9 (55?) اعطت نتيجه إيجابيه حامله لل CRISPR 2.1 والأربعة عينات الأخرى قد تم تحري عنها بشكل سلبي.وهذا يعطي دورًا مهمًا لهذا الموقع في دراسة المناعة التكيفية لعزلات الاشريشيا ضد الحمض النوويDNA أو الحمض النووي الريبيRNA الغريب ، وقد وثقت هذه النتيجة على أن البكتيريا الإشرشيا القولونية قد أصيبت بغازات العاثيات البكترية ، وقد لوحظت النتائج أن عدم وجود CRISPR مابين عينات البراز الأربعة يعطي دليلاً على أن هذه العزلات تشكل جزءًا من البكتريا النورمال فلورا الطبيعية للأشخاص الأصحاء.
وقد تم قبول الدراسة لاستيفائها الشروط اللازمة .. فالف الف مبروك للطالبة والسادة المناقشين والمشرف مع تمنياتنا للجميع بالمزيد من التفوق والنجاح في خدمة بلدنا العزيز وجامعتنا الحبيبة بابل.
بقلم :عباس مجيد